ҚБСА Қолданбалы экология Орталығының кеңес беру қызметтері: 

• жануарлар дүниесін тиімді пайдалану және сақтау байынша биологиялық негіздеме даярлау, оның ішінде табиғаттан алу, жануарларды еріксіздікте ұстау және көбейту, интродукция мен реинтродукция шаралары;
• ерекше қорғалатын табиғи аумақтарды (ЕҚТА) құру немесе кеңейту мақсатында жаратылыстану-ғылыми және техникалық-экономикалық негіздеме жасау; ;
• ЕҚТА басқару жоспарларын даярлау;
• жануарлар санағын жүргізу, зоологиялық және геоботаникалық карта жасау;
• биоалуантүрлілікті сақтау және зерттеуге қатысты мәселелер бойынша кеңес беру;
• экологиялық турларды жосарлау және т.б.     

Орталықтың орындаған қызметтері:

"Ұлытау" мемлекеттік табиғи саябағы және Ұлытау-Арғанаты табиғи қаумалы құрылысының жаратылыстану-ғылыми негіздемесін жасау; "Алтын Дала" бағдарламасы, шиқылдақ қаздың миграциясын зерттеу, Пржевальский жылқысы реинтродукциясы және Бүкіләлемдік табиғи мұра құрамына енгізу мақсатында Батыс Тянь-Шань номинациясын даярлауда ғылыми қамтамасыз ету;  маңызды орнитологиялық аумақтарды мониторингілеу және олар бойынша мәлімет жинау, BirdLife International дерекқорын толтыру; Рамсар аймақтарын сипаттау бойынша қызмет ету; бірнеше жануарлар түрлері реинтродукциясына және ауланатын жануарлар түрлерін пайдалануына биологиялық негіздеме жасау.